浙江大学教授，博士生导师；H-index & My Citations (Google Scholar)

中国药理学会分析药理学委员会委员，青年委员会副主任，常务委员；中国化学会计算机化学委员会委员；中国计算机学会生物信息学专业组委员；重庆市生物信息学会副理事长

zhufeng@zju.edu.cn（常用邮箱），prof.zhufeng@gmail.com；0571-88208444

药物化学、药物设计、新药靶发现、生物信息学和系统生物学

运用人工智能（机器学习、深度学习）、复杂网络分析等生物信息学手段和组学（蛋白组、代谢组）新技术，分析和发现具有治疗效用药物靶点的成药性和系统生物学特性，发展新颖的用于新药靶发现的预测方法和在线工具，并进一步研究药物与重要靶点的相互作用机制。

国家“千人计划”青年项目/青年千人

科技部创新人才推进计划重点领域创新团队核心成员

浙江省“千人计划”创新长期

浙江省高层次人才引进特聘专家

重庆市科学技术奖科技进步一等奖（排名第四）

重庆市高层次人才第二类

唐立新优秀科研教师奖

浙江大学“百人计划”

重庆大学“百人计划”

在研项目

2019年01月开始（项目主持人）：国家自然科学基金面上项目（81872798）

2018年09月开始（子课题骨干）：国家重点研发计划“精准医学研究”重点专项（2018YFC0910500）

2018年01月开始（项目主持人）：浙江大学青年科研创新专项（2018QNA7023）

2017年07月开始（项目主持人）：浙江大学“百人计划”基金（ZJU2017070）

2016年08月开始（课题负责人）：国家重点研发计划“精准医学研究”重点专项（2016YFC0902200）

2015年12月开始（项目主持人）：重庆市新药创制（化药类）主题专项（cstc2015zdcy-ztzx120003）

结题项目

2014年06月开始（项目主持人）：国家“千人计划”青年项目（IRPC-Y-CQU2014-ZF）

2014年06月开始（项目主持人）：中央高校基本科研跨学科重大项目（CDJZR14 46 88 01，结题优秀）

2013年01月开始（项目主持人）：中央高校基本科研跨学科重点项目（CQDXWL-2012-Z003，结题优秀）

2013年01月开始（项目主持人）：国家自然科学基金青年项目（81202459）

2012年09月开始（项目主持人）：重庆市自然科学基金（cstc2012jjA10116）

2012年07月开始（项目主持人）：重庆大学“百人计划”基金（0903005203176，考评优秀）

*corresponding author; highlighted graphic abstract

1. J. Tang, J. B. Fu, Y. X. Wang, B. Li, Y. H. Li, Q. X. Yang, X. J. Cui, J. J. Hong, X. F. Li, Y. Z. Chen, W. W. Xue, F. Zhu*. ANPELA: analysis and performance-assessment of the label-free quantification workflow for metaproteomic studies. Brief Bioinform (当年影响因子: 7.065, 生物一区 TOP 期刊). doi: 10.1093/bib/bby127 (2019).
2. Y. H. Li, X. X. Li, J. J. Hong, Y. X. Wang, J. B. Fu, H. Yang, C. Y. Yu, F. C. Li, J. Hu, W. W. Xue, Y. Y. Jiang, Y. Z. Chen*, F. Zhu*. Clinical trials, progression-speed differentiating features, and swiftness rule of the innovative targets of first-in-class drugs. Brief Bioinform (当年影响因子: 7.065, 生物一区 TOP 期刊). doi: 10.1093/bib/bby130 (2019).
3. Y. Zhang, J. B. Ying, J. J. Hong, F. C. Li, T. T. Fu, F. Y. Yang, G. X. Zheng, X. J. Yao, Y. Lou, Y. Q. Qiu, W. W. Xue*, F. Zhu*. How chirality determines the selective inhibition of histone deacetylase 6? A lesson from Trichostatin A enantiomers based on molecular dynamics. ACS Chem Neurosci (当年影响因子: 4.211, 化学二区 TOP 期刊). doi: 10.1021/acschemneuro.8b00729 (2019).
4. Y. H. Li, C. Y. Yu, X. X. Li, P. Zhang, J. Tang, Q. X. Yang, T. T. Fu, X. Y. Zhang, X. J. Cui, G. Tu, Y. Zhang, S. Li, F. Y. Yang, Q. Sun, C. Qin, X. Zeng, Z. Chen, Y. Z. Chen*, F. Zhu*. Therapeutic target database update 2018: enriched resource for facilitating bench-to-clinic research of targeted therapeutics. Nucleic Acids Res (当年影响因子: 11.561, 生物一区 TOP 期刊). 46(D1): 1121-1127 (2018).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.22% in 2019.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.36% in 2018.

领域内专家评论:

• Introduced by OMICTOOLS as "useful for facilitating patient focused research, discovery and clinical investigations of the targeted therapeutics".

5. F. Zhu*, X. X. Li, S. Y. Yang, Y. Z. Chen*. The clinical success of drug targets prospectively predicted by the in-silico study. Trends Pharmacol Sci (当年影响因子: 12.797, 医学一区 TOP 期刊). 39(3): 229-231 (2018).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.17% in 2019.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.21% in 2018.

6. W. W. Xue, F. Y. Yang, P. P. Wang, G. X. Zheng, Y. Z. Chen, X. J. Yao, F. Zhu*. What contributes to serotonin-norepinephrine reuptake inhibitors' dual-targeting mechanism? The key role of transmembrane domain 6 in human serotonin and norepinephrine transporters revealed by MD simulation. ACS Chem Neurosci (当年影响因子: 4.211, 化学二区 TOP 期刊). 9(5): 1128-1140 (2018).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.49% in 2019.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 1.11% in 2018.

7. F. Y. Yang, G. X. Zheng, T. T. Fu, X. F. Li, G. Tu, Y. H. Li, X. J. Yao, W. W. Xue*, F. Zhu*. Prediction of binding mode and resistance profile for dual-target pyrrolyl diketo acid scaffold against HIV-1 integrase and reverse-transcriptase associated ribonuclease H. Phys Chem Chem Phys (当年影响因子: 4.123, 化学二区 TOP 期刊). 20(37): 23873-23884 (2018).

封底论文:

• The Back Cover Article of Phys Chem Chem Phys 2018 20(37), Download the Cover HERE.

8. Z. J. Han, W. W. Xue, L. Tao, F. Zhu*. Identification of novel immune-relevant drug target genes for alzheimer's disease by combining ontology inference with network analysis. CNS Neurosci Ther (当年影响因子: 3.495, 医学二区期刊). 24(12): 1253-1263 (2018).

封面论文:

• The Cover Article of CNS Neurosci Ther 2018 24(12), Download the Cover HERE.

9. B. Li, J. Tang, Q. X. Yang, S. Li, X. J. Cui, Y. H. Li, Y. Z. Chen, W. W. Xue, X. F. Li, F. Zhu*. NOREVA: normalization and evaluation of MS-based metabolomics data. Nucleic Acids Res (当年影响因子: 10.162, 生物一区 TOP 期刊). 45(W1): 162-170 (2017).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 2.07% in 2019.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 2.98% in 2018.

领域内专家评论:

• Introduced by OMICTOOLS as "provided valuable guidance to the selection of suitable algorithm in metabolomics".
• Discussed in StackExchange as "works fine" and "corrections for batches without QC options".

10. P. P. Wang, X. Y. Zhang, T. T. Fu, S. Li, B. Li, W. W. Xue*, X. J. Yao, Y. Z. Chen, F. Zhu*. Differentiating physicochemical properties between addictive and nonaddictive ADHD drugs revealed by molecular dynamics simulation studies. ACS Chem Neurosci (当年影响因子: 4.348, 化学二区 TOP 期刊). 8(6): 1416-1428 (2017).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 2.66% in 2019.

11. H. Yang, C. Qin, Y. H. Li, L. Tao, J. Zhou, C. Y. Yu, F. Xu, Z. Chen, F. Zhu*, Y. Z. Chen*. Therapeutic target database update 2016: enriched resource for bench to clinical drug target and targeted pathway information. Nucleic Acids Res (当年影响因子: 9.202, 生物一区 TOP 期刊). 44(D1): 1069-1074 (2016).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.76% in 2019.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.71% in 2018.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.87% in 2017.

12. F. Zhu, Z. Shi, C. Qin, L. Tao, X. Liu, F. Xu, L. Zhang, Y. Song, X. H. Liu, J. X. Zhang, B. C. Han, P. Zhang, Y. Z. Chen*. Therapeutic target database update 2012: a resource for facilitating target-oriented drug discovery. Nucleic Acids Res (当年影响因子: 8.026, 生物一区 TOP 期刊). 40(D1): 1128-1136 (2012).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.60% in 2019.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.62% in 2018.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.31% in 2017.

领域内专家评论:

• "FACULTYof1000" as "the top 2% of published articles in biology and medicine" and "a most useful resource for scientists and companies working on drug discovery and validation, drug lead discovery and optimization, and the development of multi-target drugs and drug combinations".
• Prof. Chris Southan in his blog as "Therapeutic Target Database in PubChem".

13. F. Zhu, C. Qin, L. Tao, X. Liu, Z. Shi, X. H. Ma, J. Jia, Y. Tan, C. Cui, J. S. Lin, C. Y. Tan, Y. Y. Jiang*, Y. Z. Chen*. Clustered patterns of species origins of nature-derived drugs and clues for future bioprospecting. Proc Natl Acad Sci U S A (当年影响因子: 9.432, 综合性一区 TOP 期刊). 108(31): 12943-12948 (2011).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 0.94% in 2019.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 1.16% in 2018.
• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 1.91% in 2017.

领域内专家评论:

• "It Takes 30" of Department of System Biology @ Harvard Medical School as "Drugs run in families".
• International Cooperative Biodiversity Groups as "Highlighted literature citations for Aug 2011".

科技媒体及新闻报道:

• NEWS MEDICAL. Sep 8th, 2011.
• Medical News Today (MNT). Sep 7th, 2011.
• mediLexicon.com. Sep 7th, 2011.
• BrightSurf.com. Sep 7th, 2011.
• SCIENCE CODEX. Sep 6th, 2011.
• Sciencenewsline biology. Sep 6th, 2011.
• MedicalXpress. Sep 6th, 2011.
• FirstScience News. Sep 6th, 2011.
• Labspaces.net. Sep 6th, 2011.
• EurekAlert. Sep 6th, 2011.
• eBioNews. Sep 1st, 2011.
• ScienceDaily. Aug 31st, 2011.
• HealthCanal.com. Aug 31st, 2011.
• News Ecology. Aug 31st, 2011.

14. F. Zhu, B. C. Han, P. Kumar, X. H. Liu, X. H. Ma, X. N. Wei, L. Huang, Y. F. Guo, L. Y. Han, C. J. Zheng, Y. Z. Chen*. Update of TTD: therapeutic target database. Nucleic Acids Res (当年影响因子: 7.479, 生物一区 TOP 期刊). 38(D1): 787-791 (2010).

ESI高被引或扩展高被引论文:

• The Percentile in Subject Area shown in InCites™ was 2.95% in 2017.

15. F. Zhu, L. Y. Han, C. J. Zheng, B. Xie, M. T. Tammi, S. Y. Yang, Y. Q. Wei, Y. Z. Chen*. What are next generation innovative therapeutic targets? Clues from genetic, structural, physicochemical and system profile of successful targets. J Pharmacol Exp Ther (当年影响因子: 3.867, 医学二区 TOP 期刊). 330(1): 304-315 (2009).

所构建方法的临床或实验验证:

• Pasireotide targeting Somatostatin receptor 1 was approved by FDA in 2011.
• Fingolimod targeting S1P receptor was approved by FDA in 2010.
• Ecallantide targeting Plasma Kallikrein was approved by FDA in 2009.
• Cinryze targeting C1 esterase was approved by FDA in 2009.
• Icatibant targeting BK-2 receptor was approved by FDA in 2008.
• Plerixafor targeting CXCR4 was approved by FDA in 2008.

中国化学会第三十一届学术年会（2018）第二十四分会103A分会vice-chairman，浙江大学，杭州

亚洲药学科学联盟二零一七学术会议（2017）“代谢组学”分会chairman，厦门大学，厦门

第十四届全国计算机化学学术会议（2017）学术委员会委员，南京大学，南京

第二届中国计算机学会生物信息学会议（2017）学术委员会委员，中南大学，长沙

第六届国际药物化学大会（2016）“多靶点药物和蛋白-蛋白相互作用”分会chairman，中国药科大学，南京

第六届国际药物化学大会（2016）“药物转运体及药代、药效”分会vice-chairman，中国药科大学，南京

第二届生物信息学与药物设计研讨会（2016）大会组委会主席和学术委员会委员，重庆大学，重庆

第十三届全国计算机化学学术会议（2015）学术委员会委员，中山大学，广州

首届天然产物合成和药物先进制造方法国际研讨会（2012）组织委员会委员，重庆大学，重庆

大会报告
• 首届西湖临床研究与评价技术大会（2018）浙江大学医学院附属第一医院，杭州
• 第十一届中日药物分子设计与开发研讨会（2018）浙江大学与中国医学科学院药物研究所，绍兴
• 第十三届长江三角洲药物化学研讨会（2017）中国科学院合肥物质科学研究院与安徽省药学会，合肥

邀请报告
• 二零一八年中国遗传学会第十次全国会员代表大会（2018）南京农业大学，南京
• 十四届中国药学会青年药学论坛（2018）中国药学会与杭州经济技术开发区管委会，杭州
• 第二届世界华人计算生物和分子模拟大会（2018）中山大学药学院，广州
• 中国化学会第三十一届学术年会（2018）中国化学会与浙江大学，杭州
• 亚洲药学科学联盟二零一七年年会（2017）中国药学会与厦门大学药学院，厦门，中国
• 第十四届全国计算化学学术会议（2017）中国化学会计算机化学委员会与南京大学化学化工学院，南京
• 第五届华西药学院研究生学术论坛（2017）四川大学华西药学院靶向药物与释药系统教育部重点实验室，成都
• 第二届创新药物研发与应用大会（2017）南京生物医药谷发展中心与国家千人智库千人杂志，南京
• 生物信息学与智能信息处理二零一七年学术会议（2017）中国人工智能学会与上海交通大学，上海
• 第五届数学、计算机与生命科学交叉研究青年学者论坛（2017）中国科学院数学与系统科学研究院，北京
• 第二届精准医疗与未来医学大会（2017）杭州经济技术开发区管理委员会与国家千人智库千人杂志，杭州
• 中国生物工程学会第二届青年科技论坛（2017）中国生物工程学会与华南理工大学生科院，广州
• 二零一六年度复旦大学光华青年学者论坛生物医药分论坛（2016）复旦大学，上海
• 二零一六年第六届国际药物化学大会（2016）国家外国专家局与中国药科大学，南京
• 第一届靶向治疗与分子药物国际研讨会（2016）重庆文理学院创新靶向药物国际研究院，重庆
• 第四届分子模拟国际大会（2016）上海交通大学与中国化学会计算机化学专业委员会，上海
• 第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会（2016）电子科技大学与中国细胞生物学学会，成都
• 二零一六年精准医疗与未来医学大会（2016）西安交通大学与国家千人智库千人杂志，西安
• 第十二届中美华人化学教授会议（2016）中山大学化学与化工学院与中山大学药学院，广州
• 二零一六年同济大学国际青年学者论坛（2016）同济大学，上海
• 第二届生物信息学与药物设计研讨会（2016）重庆大学药学院与上海市生物信息学会，重庆
• 生物信息学与智能信息处理二零一六年学术会议（2016）吉林大学与中国人工智能学会，吉林
• 中国化学会第三十届学术年会（2016）大连理工大学与中国化学会，大连
• 二零一六年上海生物信息学会学术沙龙（2016）复旦大学与上海市生物信息学会，上海
• 二零一六年大数据与精准生物医学信息学研讨会（2016）中国交叉科学学会与上海交通大学，上海
• 中国化学会第十三届全国计算化学学术会议（2015）中山大学药学院与中国化学会，广州
• 第六届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（2012）中国药科大学与与中国化学会计算机化学委员会，南京